在预选赛中，10个小组第一分别是法国、丹麦、捷克、瑞典、德国、希腊、英格兰、保加利亚、意大利、瑞士。附加赛中，荷兰客场0-1、主场6-0逆转屠杀苏格兰，克罗地亚总比分2-1淘汰斯洛文尼亚，俄罗斯总比分1-0淘汰威尔士，西班牙两回合总比分5-1双杀挪威。拉脱维亚总比分3-2淘汰土耳其，历史上首次杀进欧洲杯决赛圈。
A组的揭幕战爆出大冷，卡拉古尼斯远射破门，小小罗送点，巴西纳斯扩大比分，小小罗终场前破门难挽败局，希腊爆冷取胜。另一边贝莱隆一锤定音，西班牙1-0小胜俄罗斯。第二轮，莫伦特斯与查理斯蒂亚斯各入一球，西班牙战平希腊，东道主则由马尼切和鲁伊-科斯塔进球，2-0送俄罗斯提前出局。末轮必须取胜的葡萄牙由努诺-戈麦斯打进制胜球，战胜西班牙，希腊1-2负于俄罗斯，但凭借比西班牙多进两个球的优势惊险晋级。
B组的英法大战更加经典，小贝助攻兰帕德首开纪录，但他随后又射失了鲁尼制造的点球，补时阶段，齐达内罚进直接任意球，随后又罚进点球，卫冕冠军133秒完成逆转！法国队第二轮凭借特雷泽盖的争议球险平克罗地亚，英格兰则3-0完胜瑞士，小将鲁尼梅开二度，杰拉德锦上添花。末轮打平即可出线击败瑞士，齐祖亨利先后建功。英格兰4-2痛击格子军，斯科尔斯兰帕德破门，小将鲁尼再度梅开二度，英法携手晋级。
C组中，保加利亚0-5负瑞典，0-2负丹麦，1-2负意大利，全败出局，马丁-彼得罗夫打入唯一进球。意大利0-0战平丹麦，随后1-1战平瑞典，伊布神蝎摆尾演绎经典。意大利两连平陷入危局，瑞典丹麦只需2-2或者更大的平局即可携手晋级。米兰射手托马森上下半场各入一球，拉尔森追回一球，荣松第89分钟的进球宣告了意大利人的死刑。坏小子卡萨诺伤心不已，意大利人为自己的慢热付出代价。瑞典丹麦携手晋级。
D组中，荷兰、德国、捷克三支老牌劲旅围剿新军拉脱维亚。捷克险些失手，凭借巴罗什和海因茨的进球惊险逆转拉脱维亚，德荷大战中弗林斯任意球破门，范尼小角度神奇侧钩扳平。德国人次战继续了糟糕状态，逃脱两个点球后0-0逼平拉脱维亚。荷兰与捷克则踢出了对攻足球的巅峰之作，小将罗本2次助攻助荷兰领先，随后扬科勒追回一球，海廷加被罚下，巴罗什扳平，斯米切尔89分钟绝杀！一场超级逆转，1张红牌3个门框5个进球令人窒息。荷兰末轮3-0完胜拉脱维亚，捷克2-1逆转德国，助荷兰反超德国出线决赛的葡英大战成为本届比赛最经典的对决，欧文开场3分钟灵巧破门，波斯蒂加第82分钟扳平。鲁伊-科斯塔第109分钟世界波破门反超，兰帕德第115分钟破门扳平。点球大战中，贝克汉姆与鲁伊-科斯塔先后踢飞，里卡多摘掉手套力擒瓦塞尔，随后自己罚进点球制胜，葡萄牙淘汰英格兰率先晋级。其他几场1/4决赛中，查理斯蒂亚斯头球破门，希腊爆冷1-0淘汰大热门法国。荷兰人连续4届欧洲杯迎来点球大战，范德萨扑出梅尔贝里的点球，小将罗本罚进，荷兰淘汰瑞典终结噩梦。捷克继续发威，3-0完胜丹麦搭上四强末班车。
半决赛首先在上届欧洲杯止步半决赛的荷兰与葡萄牙之间展开，德科助攻小小罗首开纪录，小小罗又助攻马尼切打进世界波，随后安德拉德打进乌龙球，葡萄牙2-1有惊无险的战胜荷兰，首次进军欧洲杯决赛。希腊迎战四连胜的捷克，内德维德伤退，两队90分钟内战平。加时赛第105分钟，德拉斯抢角球前点头球破门，“不是金球胜似金球啊！”重新开球后科利纳鸣哨，七名捷克球员倒地痛苦，这个角球也是他们近30场比赛里丢掉的首粒角球。
葡萄牙当地时间2004年7月4日20时45分，里斯本光明球场，世界足球史上最神奇的神话诞生了。葡萄牙势在必得，他们没有理由让冠军旁落。然而场面占优的他们却没有多少实质机会，第57分钟，小小罗将球解围出底线，希腊队获得本场第一个角球，巴西纳斯右侧罚出，查里斯特亚斯力压科斯蒂尼亚与卡瓦略，将球顶向了里卡多背后的空门，希腊1-0领先！葡萄牙愈发急躁，小小罗菲戈也错失良机。随着主裁默克一声哨响，希腊门将尼科波利迪斯跪地高呼，希腊神话写成了！小小罗泣不成声，希腊诸神走上神坛！奥托大帝再一次创造奇迹，一个不可复制的奇迹。
1.希腊队此前参加过两届世界大赛未尝胜绩，1980年参加欧洲杯仅仅1平2负。本届欧洲杯是他们第二次参加，赛前夺冠赔率仅为1赔80。然而他们却成为世界大赛史上最黑的黑马，成为首支在同一届比赛中同时击败东道主与卫冕冠军的球队，也成为首支在大赛淘汰赛阶段不失球的球队。
5.2004年的欧洲杯决赛，双方都是首次进入决赛，这还是欧洲杯历史首次。毕竟让第一届欧洲杯的冠亚军享有这个纪录是没有意义的。
6.2004年的世界足坛原本看上去是属于葡萄牙的，葡超球队波尔图爆冷夺得欧冠，葡萄牙也以东道主身份杀进欧洲杯决赛。然而最终的结果是，2004年属于黑马，属于蓝色。
11.荷兰队在1/4决赛的点球大战中战胜瑞典，终于取得了他们在世界大赛中的首场点球大战胜利，也终结了连续3届欧洲杯止步点球大战的噩梦。